DNAMAN里面，序列的注释要怎么给加上去，把带注释的序列导出来以后，它怎么又不显示了呢，这是在处理质粒图谱、整理基因片段、标记酶切位点，还有写序列报告的时候，挺容易碰上的一些情况。DNAMAN这个软件，它能做序列的编辑、限制性内切酶的分析、多条序列的比对、PCR引物的选择、蛋白序列的分析，还有数据库的管理这些事情，同时，也支持像GenBank、FASTA、GCG、CLUSTAL、PIR、GDE这些格式的序列信息交换。但是得留心一个事儿，就是注释它到底能不能给你显示出来，不光是看你有没有往上头写说明的文字，还得看这个注释，是不是给存成了软件能认得出来的那种feature的信息，再有就是，你导出去的那个文件格式，它是不是支持这些信息。

　　一、DNAMAN序列注释怎么添加

　　在往上头添加序列的注释之前，要先给分分清楚，你这会儿是在给一个区域做标记，还是就光是在文档里面写上一段说明就完事了。那种真能用得上的序列注释，它是应该跟具体的碱基，或者是氨基酸的位置给绑在一块的，就比方说，启动子、CDS、引物结合的那些区域、酶切位点、突变位点，还有标签序列这些。

　　1、先去把要用的那个目标序列给打开

　　进到【Sequence Editor】这个编辑器里面，把要做标记的那个DNA、RNA，或者是蛋白的序列给打开，完了以后，先去确认一下序列的方向、长度，还有那个编号，这些都没什么问题才行。

　　要是序列那个方向，一开头就给弄反了，那后头再加上去的那些CDS、引物的位置，还有酶切的区域，就全都会跟真实的结果对不上了。碰到那种质粒或者是基因片段这类的文件，最好是先把起点和方向给弄准了，然后再动手去添加注释。

　　2、把打算做标记的那个区域给选中

　　拿鼠标把要标的那一段序列给选上，然后再把跟它对应的那个名字，还有说明给添上去，就比方说，promoter、CDS、primer、mutation、His-tag这一些。在写注释的时候，是要把起头和结束的位置、方向，还有它是个什么功能，都给写清楚了，别就光写个什么“区域1”“片段2”这种，到了后面连自己都瞧不明白的名字。

　　3、把注释的那个名称和类型，给它弄规范了

　　要是后面还想着去跟别的软件交换文件，那这个注释的名儿，最好是能尽量往常见的那种feature的写法上去靠。像GenBank、EMBL，还有DDBJ这一类的核酸序列数据库，它们老早就在用那种feature table，来把序列里面那些个位点和功能区域给记下来了。所以说，这个注释，别光靠着颜色去区分它，最好是能让它的名称、类型，还有位置，每一项自己就能把事儿给说明白了。

　　二、DNAMAN序列注释导出后为什么不显示

　　都导出完了，结果却瞧不见注释，这里头最常撞见的缘由，倒不是你没去做注释，而是你导出去的那个文件格式，它本身就不存那个注释的信息。好些人，把带着注释的序列，给导成了FASTA的格式，再一导进别的软件里面，就瞅见光剩下一串序列了，这个是再正常不过的情况了。

　　1、去检查一下你导出去的那个格式，它到底支不支持保留注释

　　要是你给导出成【FASTA】那种格式了，那一般来讲，它就只能是给你留下序列的那个ID，还有序列它自己。在NCBI对FASTA格式的说明里面，FASTA的那个定义的行，是用大于号来开头的，后头跟着一串，不能重复的序列的ID，再往下，才是那个核苷酸序列的内容。这个东西，它生来就不是为了去保存那种完整的feature注释而设计的，所以说，导出去以后看不见注释，那是很常见的事。

　　2、要优先去选像GenBank这一类的格式

　　要是你想把那些基因、CDS、突变位点，还有引物区域这些注释都给留住，那就得优先去挑那种，能够把feature table给存下来的格式。GenBank这个东西，它本身就是一个带着注释的，公共的DNA序列的集合，在相关格式的那些资料里面，也说到了，那个feature table的部分，就是拿来保存像基因、转录本，还有区域这些注释信息的。要是你导出去以后，还得再交给别人接着去查看那些注释，那GenBank这类格式，一般是比FASTA要更加合适的。

　　3、要去确认一下，导出的时候，那些选项没有给漏掉

　　有那么一些个软件，在导出的时候，是会让你去选，是光导出序列、还是导出你选中的那一片、是导出features，还是导出完整的记录。要是你只导出了选中的那一小段序列，再或者，是没把那个“包含注释信息”的选项给勾上，那最后出来的那个文件里面，也是可能没有注释的。在导出以前，是要去查一查文件的预览，或者是干脆拿文本的方式给它打开，去确认一下里面到底有没有像FEATURES、gene、CDS、misc_feature这些东西。

　　三、DNAMAN注释显示异常怎么排查

　　注释导出去以后不给你显示，这个还可能，是跟你打算导入的那个目标软件有关系。可不是所有的软件，都会按着同一种路数去读那个feature的，有些软件它能读得了GenBank的序列，但是，可不保证一定就能把全部的注释字段都给摆出来。

　　1、去检查一下，那个注释它是不是真的给存下来了

　　把文件给保存好了以后，再重新去打开原来那个DNAMAN的文件，去看一眼注释它还在不在那里头。要是重新打开这个文件，就瞅不见注释了，那就说明，你前头只不过是做了一个临时的显示，或者是文档上的标记，可它压根儿就没给写进序列的那个记录里面去。碰见这种情况，就要倒回到最开始的序列那里，再去重新添加一回，而且，还得确认好了，这回保存的，是那种带着注释的序列文件。

　　2、去查一查你要导入的那个软件，它的显示开关在哪儿

　　有那么一些软件，东西导进去了以后，它是默认就把那些feature给藏起来的，你得去【Feature】或者【Annotation】这些个相关的面板里面，去把它显示的功能给打开。在导进去了以后，不要光是盯着那个主序列的窗口去看，也还得去看一看功能区、图谱区，或者是注释的列表，去弄弄清楚，是不是只不过是没给露出来而已。

　　3、要避免光拿截图，或者是报告，去替代那个注释

　　要是你只不过是把图片、PDF，或者是Word的报告给导出来了，那这个注释，它很可能，就只是在图面上能看得见，可别的那些序列软件，就再也读不了它了。在还需要接着去编辑，或者是跟人去交换的时候，是该在同一个时候，去保存上一份带着feature信息的序列文件，完了以后，再另外去导出报告或者是图片。

　　总结

　　DNAMAN的序列注释要怎么去添加，导出来以后怎么它又不显示了呢，这些个事，它里头的那个关键，是在于要把注释给紧紧地绑在具体的序列位置上，而且，还得去用那种能把feature的信息给存下来的格式。在添加的时候，要去核对好序列的方向、做标记的那个区域、还有注释的名称跟类型；在往外头导出的时候，别就只盯着那个FASTA，或者是普通的文本格式，是要先紧着那种能把注释给留下来的格式去选。要是导出来以后还是瞅不见，那就去查一查导出的选项、要导入的那个软件的显示开关，还有文件它本身的内容。这么一路给处理下来，DNAMAN里面的那些个序列注释，才不会就光是在自个儿的电脑上能看得见，而是能实实在在地，给用到后头接着的分析，还有材料的交付里面去。